Podczas próby powrotu na swoją planetę kudłaty kosmita Alf zostaje schwytany przez amerykańską armię. Wojskowi naukowcy zamierzają poddać go serii eksperymentów, które mają na celu poszerzenie dostępnych informacji o kosmitach. Nad sprawnym przeprowadzeniem badań czuwa, znany ze swej obsesyjnej niechęci do obcych, pułkownik Gilbert Milfoil (Martin Sheen). Alf, aby uniknąć zagrożenia, postanawia upozorować własne porwanie.